簡(jiǎn)介

流感病毒全基因組分析系統(tǒng)，是一款提供圖形操作界面的流感病毒全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)自動(dòng)化分析系統(tǒng)。相較于常規(guī)熒光定量PCR技術(shù)，全基因組測(cè)序技術(shù)具有更強(qiáng)的檢測(cè)靈敏度，為流感病毒的鑒定、變異檢測(cè)、監(jiān)測(cè)等帶來(lái)了技術(shù)革命。本系統(tǒng)是流感病毒全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的配套分析系統(tǒng)，兼容當(dāng)前主流二代和三代納米孔原始測(cè)序數(shù)據(jù)，實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)快速分析，能夠提供流感病毒分型、甲型流感病毒HA和NA基因區(qū)段溯源分析、乙型流感兩種家系（Victoria和Yamagata）分型分析、變異檢測(cè)、覆蓋度展示以及組裝完成的基因組序列。

本系統(tǒng)與常規(guī)Linux Shell命令行調(diào)用多種程序測(cè)序數(shù)據(jù)分析相比，提供從下機(jī)數(shù)據(jù)到結(jié)果報(bào)告一鍵式操作，解決了命令行操作難度大、數(shù)據(jù)結(jié)果分析可視化復(fù)雜等問(wèn)題。通過(guò)高度優(yōu)化的集成分析流程與完善的數(shù)據(jù)庫(kù)，可將分析時(shí)間縮短至10分鐘內(nèi)。

功能介紹

流感病毒全基因組分析系統(tǒng)可針對(duì)二代及三代納米孔測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析，具體功能如下：

1.支持單樣本和多樣本數(shù)據(jù)導(dǎo)入分析；

2.提供從下機(jī)數(shù)據(jù)到分析結(jié)果一鍵式操作；

3.提供甲乙丙丁四種流感病毒鑒定和基因組變異檢測(cè)；

4.內(nèi)置流感數(shù)據(jù)庫(kù)，提供序列比較分析，支持自上傳樣本共同分析，結(jié)果以變異比較列表和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的方式展示；

5.提供流感病毒的全基因組覆蓋度圖和組裝完成的一致性序列；

6.甲型流感提供亞型鑒定、HA和NA基因溯源分析；

7.乙型流感兩種家系（Victoria和Yamagata）分型分析，支持疫苗株及其他細(xì)分進(jìn)化樹(shù)分析

8.提供結(jié)果數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)以及圖表輸出功能；

9.提供樣本管理系統(tǒng)，支持輸入樣本的具體信息，包括病案信息、取樣信息、臨床診斷信息，支持樣本信息和數(shù)據(jù)分析管理關(guān)聯(lián)等；

10.支持一鍵輸出可打印的分析報(bào)告，支持圖形和表格等結(jié)果的下載和輸出。

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