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HLA肽組學如何助力癌癥抗原識別?檢測技術服務詳情介紹
腫瘤miǎnyìzhìliáo(Cancer Immunotherapy)核心問題:T細胞如何識別腫瘤?
T細胞并不直接識別癌細胞本身,而是通過主要組織相容性復合體(MHC,亦稱HLA)呈遞的肽段,間接判斷細胞是否“異常”。因此,識別并解析HLA呈遞肽段,尤其是那些源自癌基因突變、異常表達或病毒整合的“癌癥抗原肽”,就成為構建腫瘤疫苗、TCR-T細胞療法等免疫策略的前提。而實現這一目標的關鍵技術之一,正是HLA肽組學(Immunopeptidomics)。
一、什么是HLA肽組學?
HLA肽組學,是指以質譜為核心手段,系統性解析HLA分子在體內呈遞的內源性肽段(通常為8-12個氨基酸)的研究技術。這些肽段代表著細胞代謝狀態、突變情況和抗原負荷,是T細胞識別的“分子shēnfènzhèng”。HLA肽組學解決的問題不是“有哪些蛋白表達”,而是——“這些蛋白zuì終是如何被切割、加工,并呈遞給T細胞看的?”
二、HLA肽組學如何“直觀還原”真實抗原呈遞?
1、免疫親和純化 + 質譜解析
利用特異性抗體從細胞表面富集HLA-I/II復合物,釋放其中的結合肽段,并通過高分辨率質譜(如Orbitrap Exploris 480)直接鑒定其序列,是HLA肽組學的基本流程。相比計算預測,這種方法具有:
(1)原位識別真實存在的抗原肽
(2)捕獲突變肽段(Neoantigens)
(3)識別來自病毒、轉座子等非典型源的肽段
百泰派克生物科技已建立穩定高通量的HLA肽純化與檢測流程,兼容多種樣本類型(細胞系、腫瘤組織、PBMC等),并具備低起始量(百萬級細胞)處理能力。
2、聚焦“新抗原”(Neoantigen)
新抗原是來源于腫瘤tèyǒu突變或融合基因的新生肽段,具備“僅腫瘤表達、不存在于正常組織”的優勢,是T細胞免疫識別的理想靶點。HLA肽組學通過將質譜數據與患者WES/RNA-seq等基因組信息整合,可實現:
(1)個體化新抗原挖掘
(2) 多個突變位點肽段并行驗證
(3)“優先呈遞”肽段的免疫原性評估
這為個性化癌癥疫苗設計與TCR-T細胞工程提供了關鍵支撐。
3、跨越預測誤差
當前多數抗原篩選仍依賴于HLA結合預測算法(如NetMHCpan),但僅有10–20%的預測肽段可被實際呈遞。HLA肽組學提供“實驗實錘”,有效避免開發“預測靶點”卻無法激活免疫反應的失敗案例。
4、發掘修飾肽、非標準抗原
部分癌癥相關抗原并非源自經典蛋白翻譯,而是:
(1)非編碼區翻譯產物(uORFs、lncRNA等)
(2)翻譯后修飾(磷酸化、甲基化)調控的肽段
(3)裂解產生的雜合肽(spliced peptides)
三、應用價值:HLA肽組學賦能癌癥免疫jīngzhǔn化
百泰派克生物科技:HLA肽組學一站式服務
我們提供完整的HLA肽組學科研服務鏈條,覆蓋從實驗設計到數據解讀的全流程:
(1)高親和HLA復合物富集流程,提高弱表達肽段檢測率
(2)質譜平臺:Orbitrap Exploris + nanoLC系統,支持大規模樣本并行分析
(3)生信分析:HLA分型+突變肽匹配+免疫原性打分
(4)多組學整合:融合轉錄組、蛋白組、單細胞數據,jīngzhǔn定位關鍵抗原源頭
(5)合作定制開發:支持TCR-T項目靶點共建、疫苗設計驗證等產業化落地
在腫瘤miǎnyìzhìliáo日趨個性化、jīngzhǔn化的當下,僅靠預測已難滿足臨床研發需求。HLA肽組學正以其實驗驗證性、高靈敏度、廣覆蓋度的優勢,將我們帶入腫瘤真實抗原呈遞的分子視界。百泰派克生物科技致力于推動HLA肽組學的科研與應用落地,為新抗原發現、免疫靶點開發和T細胞工程等方向提供zhuānyè支持,助力科研團隊站在癌癥免疫的技術前沿。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!