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WB實(shí)驗(yàn)的基本原理及操作流程
點(diǎn)擊次數(shù)：36716 發(fā)布時(shí)間：2011-3-2
WB實(shí)驗(yàn)的基本原理及操作流程
【實(shí)驗(yàn)原理】
一個(gè)基因表達(dá)*結(jié)果是產(chǎn)生相應(yīng)的蛋白質(zhì)（或酶）。因此檢測(cè)蛋白質(zhì)是測(cè)定基因表達(dá)的主要標(biāo)志，檢測(cè)蛋白質(zhì)的方法很多，除ELISA法外，也可用與檢測(cè)DNA和RNA相類似的吸印方法。前兩法有“南”和“北”之意，故本法遂被延伸稱為Western（西）印跡法，該法能用SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳分辨出與專一抗血清結(jié)合的專一性蛋白質(zhì)。將聚丙烯酰胺凝膠上分辨出的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上并與*抗體共孵。*抗體專一地與待分離蛋自質(zhì)的抗原決定簇結(jié)合，然后用另一種蛋自質(zhì)，如135I-蛋白A或辣根過氧化物酶連接的山羊抗IgG檢測(cè)已結(jié)合上去的抗體。本法所需時(shí)間6小時(shí)或過夜。
蛋白質(zhì)的聚丙烯酰胺凝膠電泳
幾乎所有蛋白質(zhì)電泳分析都在聚丙烯酰胺凝膠上進(jìn)行，而所用條件總要確保蛋白質(zhì)解離成單個(gè)多肽亞基并盡可能減少其相互間的聚集。zui常用的方法是將強(qiáng)陰離子去污劑SDS與某一還原劑并用，并通過加熱使蛋白質(zhì)解離后再加樣于電泳凝膠上。變性的多肽與SDS結(jié)合并因此而帶負(fù)電荷，由于多肽結(jié)合SDS的量幾乎總是與多肽的分子量成正比而與其序列無關(guān)，因此SDS多肽復(fù)合物在聚丙烯酰凝膠電泳中的遷移只與多肽的大小相關(guān)。在達(dá)到飽和的狀態(tài)下，每克多肽約可結(jié)合1.4克去污劑，借助已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)參照物，則可測(cè)算出多肽鏈的分子量。
SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳大多在不連續(xù)緩沖系統(tǒng)中進(jìn)行，其電泳槽緩沖液的pH值與離子強(qiáng)度不同于配膠緩沖液，當(dāng)兩電極間接通電流后，凝膠中形成移動(dòng)界面，并帶動(dòng)加入凝膠的樣品中所含的SDS多肽復(fù)合物向前推進(jìn)。樣品通過高度多孔性的積層膠后，復(fù)合物在分離膠表面聚集成一條很薄的區(qū)帶（或稱積層）。曲于不連續(xù)緩沖系統(tǒng)具有把樣品中的復(fù)合物全部濃縮于極小體積的能力，故大大提高了SDS聚丙烯酰胺凝膠的分辨率。
zui廣泛使用的不連續(xù)緩沖系統(tǒng)zui早是由Ornsstein（1964）和Davis（1964）設(shè)計(jì)的，樣品和積層膠中含Tris-Cl（pH6.8），上下槽緩沖液含Tris-甘氨酸（pH8.3），分離膠中含Tris-Cl（pH8.8）的。系統(tǒng)中所有組分都含有0.1％的SDS（Laemmli, 1970），樣品和積層膠中的氯離干形成移動(dòng)界面的先導(dǎo)邊界而甘氨酸分子則組成尾隨邊界，在移動(dòng)界面的兩邊界之間是一電導(dǎo)較低而電位滴度較陡的區(qū)域，它推動(dòng)樣品中的多肽前移并在分離膠前沿積聚，此處pH值較高，有利于甘氨酸的離子化，所形成的甘氨酸離子穿過堆集的多肽并緊隨氯離子之后，沿分離膠泳動(dòng)。從移動(dòng)界面中解脫后，SDS多肽復(fù)合物成一電位和pH值均勻的區(qū)帶泳動(dòng)穿過分離膠，并被篩分而依各自的大小得到分離。
【常用試劑】
1）30%丙烯酰胺/0.8% N,N’-亞甲丙烯酰胺
將30克丙烯酰胺和0.8克N,N’-亞甲丙烯酰胺溶于總體積為60ml的水中，加熱至37℃溶解之，補(bǔ)加水至終體積為100ml。0.45µm微孔濾膜過濾除菌，查證該溶液pH應(yīng)不大于7.0，置棕色瓶中保存。
小心：丙烯酰胺具有很強(qiáng)的神經(jīng)毒性并可通過皮膚吸收，其作用具有累積性。稱量丙烯酰胺和N,N’-亞甲丙烯酰胺時(shí)應(yīng)戴手套和面具。可認(rèn)為聚丙烯酰胺無毒，但也應(yīng)謹(jǐn)慎操作，因?yàn)樗€可能含有少量未聚合材料。
2）4×Tris•Cl/SDS, pH8.8,
在300mlH2O中溶解91g Tris堿（1.5mol/L），用1mol/L調(diào)節(jié)pH至8.8, 補(bǔ)加H2O至體積500ml。用0.45um濾膜過濾溶液，再加入2g SDS[0.4%（w/v）]，于4℃可保存1月。
3）4×Tris•Cl/SDS, pH6.8,
在40mlH2O中溶解6.05g Tris堿（0.5mol/L），用1mol/L調(diào)節(jié)pH至6.8, 補(bǔ)加H2O至體積100ml。用0.45um濾膜過濾溶液，再加入0.4g SDS[0.4%（w/v）]，于4℃可保存1月。
4）4×SDS電泳緩沖液
Tris base 24.2 g
Glycerin 115.3 g
20%SDS 20 ml
加水至總體積1000ml。
應(yīng)用時(shí)稀釋4倍即為1×SDS電泳緩沖液（Tris 0.05M, Glycerin 0.38M, SDS 0.1%）。
5）TEMED （N,N,N’,N’-四甲基乙二胺）
TEMED通過催化過硫酸銨形成自由基而加速丙烯酰胺和N,N’-亞甲丙烯酰胺的聚合。
6）10%過硫酸銨
過硫酸銨提供驅(qū)動(dòng)丙烯酰胺和亞甲丙烯酰胺聚合所必需的自由基。可用去離子水配制小量10%（w/v）的貯存液并保存于4℃。由于過硫酸銨會(huì)緩慢分解，故應(yīng)隔周新鮮配制。
【操作步驟】
1）按廠商的使用指南用兩塊干凈的玻璃，平板和0.75mm墊片組裝電泳裝置中的玻璃平板夾層，并固定在灌膠支架上。
2）按表1配制分離膠液體并脫氣，然后加入10％的過硫酸銨和TEMED，輕輕攪拌混勻。
表1 聚丙烯酰胺分離膠的配制
試劑成分配制不同濃度分離膠所需試劑（ml）
5%8%10%12%15%
Acry:Bis （30:0.8）2.504.005.006.007.50
4×Tris•Cl/SDS, pH8.83.753.753.753.75
H2O8.757.256.255.253.25
10%過硫酸銨0.050.050.050.050.05
TEMED0.010.010.010.010.01
按所需分離的蛋白質(zhì)分子大小選擇合適的丙烯酰胺百分比濃度，一般地，5％的凝膠可用于60～200kDa的SDS變性蛋白質(zhì)分子的分離，10％用于16～70kDa，15％用于12～45kDa。
3）用一根巴斯德吸管立即將分離膠液體沿夾層中一條墊片的邊緣加入于玻璃平板夾層中，至凝膠約5cm高為止。樣品體積少于10μl不需灌制積層膠。
4）用另一根已斯德吸管，先從一邊的墊片，再從另一邊墊片往夾層的液面頂部緩緩加入一層水飽和異丁醇（厚約1cm）。讓凝膠在室溫聚合30min。
聚合后，可見在頂層異丁醇與凝膠的界面間有一清晰的折光線，膠的聚合失敗往往問題在于過硫酸按或TEMED，或兩者都有。
5）傾去頂層的異丁醇，并以1×Tris-Cl/SDS, pH8.8緩沖液沖洗凝膠的頂部表面,盡量用吸水紙吸干。
6）按表2配制積層膠液體，用吸管將液體沿一條墊片加入到玻璃平板夾層，直至夾層的頂部。
表2 聚丙烯酰胺積層膠的配制
GEL%（3.9%） Total （10.05ml）
Acry:Bis（30:0.8） 1.30 ml
4×Tris•Cl/SDS, pH6.8 2.50 ml
H2O 6.10 ml
10%過硫酸銨 0.05 ml
TEMED 0.01 ml
7）將0.75mm厚的梳子插入夾層的積層膠液體中，必要時(shí)，再補(bǔ)加積層膠液體充盈剩余空間。讓積層膠室溫聚合30min。
8）在具螺口蓋的微量離心管中，用2×SDS加樣緩沖液按1:1（v/v）稀釋待測(cè)蛋白質(zhì)樣品，于100℃煮沸5-10min。如樣品是蛋白質(zhì)沉淀物，加入50～100µl 1×SDS加樣緩沖液溶解之，并同樣在100℃煮沸5-10min。按供應(yīng)商的使用指南用2×SDS加樣緩沖液溶解蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)混合物。
對(duì)于0.3cm寬的加樣孔，推薦加樣體積以不超過20µl 為宜。用考馬斯亮藍(lán)染色法顯跡，成分很復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合物需加25～50µg，而樣品中只有一種或不多的幾種蛋白的話，只需1～10µg蛋白量。采用銀染顯跡時(shí)，樣品用量可減小10～100倍（按樣品的復(fù)雜程度在小于20µl的體積溶有0.01～0.5ng蛋白樣品不等）。
2×SDS加樣緩沖液（loading buffer）配制：
成分 體積 （ml）
0.5M Tris•Cl （pH6.8） 12.5
20%SDS 11.5
Glycerin 10
2% Blue-Bromo-phenol 2.5
β-mercaptoethanol * 5.0
加H2O至總體積50 ml，分裝
*β-mercaptoethanol 在臨用前加入。
9）小心拔出梳子，避免撕裂聚丙烯酰胺凝膠加樣孔。取出梳子后，以1×SDS電泳電泳緩沖液沖洗加祥孔，并以此緩沖液充滿之。
10）按廠商指南將凝膠板固定到電泳裝置的上緩沖液室（上槽），同時(shí)往下緩沖液室（下槽）加入推薦量的1×SDS電泳緩沖液。
11）將固定于上槽的凝膠板放入下槽中，并往上槽加入部分電泳緩沖液至剛好淹沒凝膠的加樣孔。
12）用帶平嘴針頭的50µl注射器將同樣濃度的蛋白質(zhì)樣品等體積加入到樣品孔中，小心加樣使樣品在孔的底部成一薄層，對(duì)照孔加入蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)樣品，如有空置的加樣孔，須加等體積的空白1×SDS樣品緩沖液，以防相鄰泳道樣品的擴(kuò)散。
13）再往上槽加入余下的1×SDS電泳緩沖液。此操作緩慢小心，以防沖起樣品孔中的樣品。
14）連接電源，對(duì)于0.75mm厚的垂直板電泳，先在60V下電泳至溴酚藍(lán)染料從積層膠進(jìn)入分離膠，再將電壓調(diào)至120V繼續(xù)電泳至溴酚藍(lán)到達(dá)凝膠底部為止。
15）關(guān)閉電源并撤去連接的導(dǎo)線，棄去電泳緩沖液。連同上槽一起將凝膠夾層取出。
16）將凝膠定位以便識(shí)別加樣的順序，將凝膠板從上槽解離出來，放在一疊吸水紙或紙巾上。
17）小心將封邊的墊片抽出一半，并以此為杠桿橇起上面的玻璃平板，使凝膠暴露出來。
18）小心從下面的玻璃平板上移出凝膠，在凝膠的一角切去一小塊以便在染色及干膠后仍能認(rèn)出加樣次序，接著就可進(jìn)行蛋白質(zhì)的檢測(cè)。
19）轉(zhuǎn)膜：將凝膠面與負(fù)極相連，硝酸纖維素膜與正極相連。（100V，1小時(shí)）要放于4℃。
20）清洗：將硝酸纖維素膜放入1X TBST中清洗3次，每次5分鐘。搖床搖動(dòng)。
21）封閉
22）一抗孵育：一抗用TBST1:1000稀釋，將硝酸纖維素膜放入其中，37℃孵育1.5小時(shí)，（或4℃過夜）搖床搖動(dòng)。
23）清洗：將硝酸纖維素膜放入1X TBST中清洗3次，每次5分鐘。
24）二抗孵育：二抗用TBST1:8000稀釋，將硝酸纖維素膜放入其中，37℃孵育1小時(shí)，搖床搖動(dòng)。
25）清洗：同22，之后，用1X TBS在清洗2次，每次5分鐘，以洗去膜上的Tween 20，因?yàn)樗梢宰璧K底物的沉積。
26）顯色
按如下配方配制顯色液：
1mL水+1滴（大約50微升）試劑A（之后混勻）+1滴試劑B+1滴試劑C
將硝酸纖維素膜放入其中孵育，一旦顯色，立即放入去離子水中終止反應(yīng)。