對用于清洗進樣針的溶劑，必須考慮對殘留物質（使用過的樣品等）所具有的溶解力、通常被使用的有純水或甲醇，丙酮等。

進樣針整體的清洗

1.   用溫水和非堿性，無磷的洗滌劑清洗

2.   用純水或丙酮等的溶劑進行抽取推出、進行短時間的清洗。

3.   用空氣進行干燥。

芯桿的清洗

1.   芯桿在清洗后用清潔的布等擦拭，然后裝回針筒中。

2.   在裝入針筒是請注意芯桿是否彎曲。

進樣針的清洗

1.   在清洗針時、請注意勿將針眼堵塞。

2.   在針筒內置滿清洗用的溶劑，將芯桿穩穩地推入。

3.   注意不要使針尖為銳角的針（ PT-2，PT-4等）的前端卷曲。萬一、針尖發生卷曲時，請使用針打磨器等進行研磨。