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多肽組裝中序列效應(yīng)研究獲新進展
最近更新時間：2013-3-19
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多肽組裝中序列效應(yīng)研究獲新進展
來自國家納米科學(xué)中心的研究人員利用STM技術(shù)在單分子水平上研究多肽的組裝及其調(diào)控，已經(jīng)發(fā)表了一系列的工作。他們在2011年利用STM確認了淀粉樣多肽組裝和聚集的核心片段及折疊位點，對于研究非結(jié)晶蛋白的組裝結(jié)構(gòu)提供了一種新穎的解析方法（Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2011, 108, 19605等），但是由于多肽在表面組裝構(gòu)象的多樣性以及吸附穩(wěn)定性的差異，利用STM進行多肽中氨基酸序列的識別仍具有極大的挑戰(zhàn)性。
在本研究中，研究人員利用STM結(jié)合分子動力學(xué)模擬，研究了氨基酸殘基序列對嵌段模型多肽在固體表面的吸附構(gòu)象穩(wěn)定性的影響，發(fā)現(xiàn)STM圖像中的襯度差異與模型多肽中的序列具有關(guān)聯(lián)性，同時分子動力學(xué)模擬發(fā)現(xiàn)不同氨基酸殘基與石墨表面的結(jié)合能差異與襯度差異也具有一致性，說明了多肽序列對組裝構(gòu)象和組裝特性的影響，暗示了利用STM進行多肽序列識別的可能性。此研究有助于深入理解多肽組裝過程中側(cè)基結(jié)構(gòu)、序列等對組裝過程、組裝驅(qū)動力以及組裝結(jié)構(gòu)的影響。