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菌落計數器是一種數字顯示式自動細菌檢驗儀器。由計數器、探筆、計數池等部分組成，計數器采用CMOS集成電路精心設計，LED數碼管顯示，字高13毫米，清晰明亮，配合探筆，計數靈敏準確。黑色背景式記數池內，熒光燈照明，菌落對比清楚，便于觀察。本儀器可減輕實驗人員的勞動強度，提高工效，提高工作質量，廣泛用于食品、飲料、藥品、生物制品、化妝品、衛生用品、飲用水、生活污水、工業廢水、臨床標本中細菌數的檢驗。
一般對于度要求不高的用戶，可以考慮手動的或者半自動的菌落計數器。手動的價格比較便宜，市場價大約都在800-1200元，稍微好點的，是半自動的帶有語音讀報功能的，放大倍數在3級以上的，市場價要2500元左右，這種已經能夠滿足大多數用戶的計數要求。較高配置的全自動計數器，多用在微生物實驗室里，像素主要有300萬，900萬和1000萬三個規格。軟件方面添加了很多分析功能，價格也在3-8萬。進口的菌落計數器主要來自三個國家，德國、英國和法國的。就相同功能的半自動儀器，國產的和進口的價格相差大概在2-3倍。全自動的價格也相差一倍之多。需求者應該充分考慮自己的需求側重點和預算進行選購。
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