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培養基的選擇應根據微生物生長代謝活動的需要，并有利于 合成細胞物質和生物化工產品的生成。培養基中主要含有水、碳源（能源）、氮源、礦物質，有的還需要提供維生素等。在酶反應過程中，原料液中被轉化的物質亦即酶的作用物，亦可稱為底物。
培養基的選擇一般盡可能要滿足以下要求：①單位質量基質，應能產生zui大量的生物物質或生物化工產品，并且要使所產生的生物物質或生物化工產品在發酵液中的濃度zui高，產率zui高，使不需要的其他代謝產物的生成，限在zui低范圍內。②培養基成本低、質量均一并隨時保證提供使用。③培養基使用時，對通氣、攪拌、后處理和三廢治理等方面所產生的問題zui少。
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