生物安全柜不僅可以保護樣品也可以保護操作者，所以才被成為“安全”柜。是一種負壓過濾排風柜，用于生物安全實驗室和其他實驗室的生物安全防護，可以防止操作者和環境暴露于實驗過程中產生的生物氣溶膠；對操作人員、樣品及樣品間交叉污染和環境提供安全保護。 生物安全柜可分為：一級、二級、三級。

一級生物安全柜可保護工作人員和環境而不保護樣品。其氣流原理和實驗室通風櫥基本相同，不同之處在于排氣口安裝有HEPA 過濾器，將外排氣流過濾進而防止微生物氣溶膠擴散造成污染。一級生物安全柜本身無風機，依賴外接通風管中的風機帶動氣流，由于不能保護柜內產品，目前已較少使用。　

二級生物安全柜是目前應用廣泛的柜型。按照《中華人民共和國醫藥行業標（生物安全柜）準YY0569-2005生物安全柜》中的規定，二級生物安全柜依照入口氣流風速、排氣方式和循環方式可分為4 個級別：A1 型，A2 型，B1 型和B2 型。

三級生物安全柜是為生物安全防護等級為4級實驗室而設計的，柜體*氣密，工作人員通過連接在柜體的手套進行操作，俗稱手套箱（Golve box），試驗品通過雙門的傳遞箱進出安全柜以確保不受污染，適用于高風險的生物試驗，如進行SARS、埃博拉病毒相關實驗等。