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由于污染，噪音越來越大，檢測器基線上升。污染物可能被泵以穩定的濃度打入系統，而再以穩定的濃度流出來，所以在色譜圖中不出多余的峰。
用梯度洗脫時弱流動相可以使污染物聚在柱頂，流動相強度增加后污染物可能被洗脫出來一個大的偽峰。有時基線噪音突然增大或突然提高，都是因為反復加進新的流動相或系統用得太久（通宵）所造成的。
新加進的流動相有污染物或者流動相長霉，繁殖了細菌。臟的儲液器會污染清潔的流動相。每種流動相備有的儲液器，或者定期報廢儲液器。
通用（深圳）儀器有限公司是一家提供液相色譜、離子色譜儀、原子熒光光譜儀、血藥濃度分析儀，液相色譜的相關單元部件的儀器公司。
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