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液相工作者接觸最多的是流動相，流動相是造成液相色譜儀各種問題的主要源頭。
從液相色譜儀使用的實際情況來看有幾點需要注意:
（1）液相色譜儀流動相過濾實際操作時由于不可能做到專瓶專用，容易造成的交叉污染，對于配比復雜的流動相影響更大。所以用完后一定要沖洗干凈。用前不放心的話也可以沖洗下。
（2）液相色譜儀流動相過濾經濟成本比較高。買一套過濾裝置要3000多元，且過濾器是比較容易損壞的設備。過濾片成本高，有些進口的一片就要幾十元。按一般液相柱的正常使用壽命計算，過濾片的成本會遠遠高于液相色譜儀色譜柱的成本。并且在使用過濾片時，有些會造成流動相的二次污染，原因在于不合格的過濾片。
（3）流動相過濾耗費時間長。使用溶劑過濾器有一個預清洗、裝備、使用、用后清洗，晾干的過程，至少也有一個小時的時間。這個成本也不能忽視。
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