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四川省農業科學院植物保護研究所是一所具有五十多年歷史的省級植保研究專業所，下設所行政辦公室、黨委辦公室、科研開發管理科三個職能部門；設農作物病害研究室、農作物蟲鼠害研究室、農作物抗性鑒定研究室、農藥研究室、生物防治研究中心共五個專業研究室。

該所主要研究領域包括：針對農業生產實際，進行主要糧、油、果、蔬、茶等作物病蟲草鼠等有害生物的災變規律、預警技術及防治措施的研究；主要糧經作物品種抗病蟲性鑒定評價及抗源篩選，病原菌變異監測；新農藥生物測定及使用技術研究、大田藥效測評；生物農藥、復配農藥的研制；農產品無公害生產技術及果蔬儲藏保鮮等。