1.使用一段時間后柱壓過高：
解決辦法：首先，檢查HPLC系統的原因是否合理，排除系統原因后，主要原因是實驗過程中柱中雜質的積累。為了盡可能改善操作條件，樣品應及時清洗，如緩沖鹽流動相必須用較高比例的水溶液(如90%)清洗，然后用有機相保存。
2.篩板堵塞與柱頭塌陷：
解決方案：如果確定色譜柱的濾板受到污染，則可用甲醇向相反方向清洗色譜柱至常壓，或將色譜柱除去，并小心地除去篩板。超聲處理用約5%硝酸溶液處理約20分鐘，然后用純水超聲處理約20分鐘，然后重新裝入色譜柱。
3.色譜柱填料受樣品污染：
解決方法：
如果確定色譜柱填料受到污染，則取下色譜柱螺釘，挖出色譜柱前部受污染的填料，再用相同的色譜柱填料填充。仔細修理后，重新安裝上柱螺釘。
4。色譜柱中的緩沖液中的鹽遇到高濃度的甲醇或其他有機溶劑，從而導致結晶和沉淀：
解決方法：
若確定為鹽結晶，用10%甲醇/水沖洗柱，溶解全部鹽，然后改變高濃度甲醇。
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