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超聲波破碎機由超聲波振動部件和超聲波驅動電源和反應釜三大部分構成：超聲波振動部件主要包括大功率超聲波換能器、變幅桿、工具頭(發射頭)，用于產生超聲波振動，并將此振動能量向液體中發射。換能器將輸入的電能轉換成機械能，即超聲波。其表現形式是換能器在縱向作來回伸縮運動，振幅一般在幾個微米。這樣的振幅功率密度不夠，是不能直接使用的。
組成部分：
(1)超聲波發生器，能夠將市電轉化成為實驗需要的固定電能提供給換能器，讓換能器能夠穩定的運作。
(2)超聲波換能器，可以進行縱向的機械振動，讓生物溶液中的物質產生一定的空化效應，讓介質中的生物微粒發生劇烈的振動，從而加工和處理成為實驗所需的細胞形態。
超聲波破碎機的注意事項：
1、 如超聲波粉碎機在工作時保護指示燈亮，說明超聲功率開得太大，而進入保護狀態，此時調節機器降低功率，按保護復位鍵及工作復位鍵，重新開始工作。
2、 每次使用完后，請用酒精或清水清潔變幅桿探頭。
3、 由于超聲波在液體中的空化效應，液體溫度會很快升高，建議采用短時間、多頻次的破碎，必要時可外加冰浴冷卻或使用低溫循環泵。