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葡萄糖酸氯己定，主要具有消毒、防腐作用，很多病原菌都對它是敏感的，包括葡萄球菌、變異鏈球菌、唾液鏈球菌、白色念珠菌、大腸埃希菌和厭氧菌，再比如厭氧丙酸菌，都對這個藥物是高度敏感的。此藥對革蘭氏陽性菌和陰性菌都具有一定抗菌作用，它的抗菌消毒作用比苯扎溴銨等消毒劑都要強。其抗菌作用機制主要是吸附于細胞漿膜的滲透屏障，能使細胞內容物漏出而發揮抗菌作用。低濃度時具有抑制作用，高濃度時則具有殺菌作用。因此，我們說葡萄糖酸氯己定主要具有抗菌、消毒的功效。