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技術文章

無處不在的組蛋白修飾

閱讀:805          發布時間:2018-10-9

2018 年 5 月 11 日,浙江*學院葛楚天,錢國英及杜克大學 Blanche Capel 研究組合作在學術期刊 Science 雜志發表題為「The histone demethylase KDM6B regulates temperature-dependent sex determination in a turtle species 」 探究組蛋白的甲基化對巴西龜性別決定的影響。2018 年 8 月 30 號,香港大學課題組在 Nature Communications 發文「Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2」,發現新的組蛋白修飾--賴氨酸苯甲酰化對生命活動的影響。2018 年 9 月 13 日,中科院上海藥物所在 Cell 發文「Targeting Epigenetic Crosstalk as a Therapeutic Strategy for EZH2-Aberrant Solid Tumors」探究 H3K27me 和 H3K27ac 對腫瘤發展的影響,指導聯合用藥。組蛋白修飾作為表觀遺傳學研究熱點,持續出現在高分雜志上,依舊是當然研究的重點領域。

簡單介紹下組蛋白

組蛋白是染色體基本結構-核小體中的重要組成部分,由 4 種組蛋白 H2A、H2B、H3 和 H4 各兩個分子,形成一個組蛋白八聚體,長度約為 146bp 的 DNA 分子盤繞在組蛋白八聚體構成的核心結構外面,形成了一個核小體。每個核心組蛋白 N-末端氨基酸殘基可發生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚 ADP 糖基化等多種共價修飾作用。組蛋白修飾在生命過程中起著非常重要的作用,人類很多疾病的發生與組蛋白修飾有著密切關系。

 


組蛋白研究技術手段

在生理狀態下用甲醛把細胞內特定修飾的組蛋白和 DNA 交聯在一起,超聲波將其打碎到一定長度范圍的染色質小片段,通過運用對應于一個特定組蛋白修飾的抗體,將目標片段(組蛋白發生特異修飾的片段)沉淀下來,對目的片段純化和測序,得到相關基因片段信息。


組蛋白案例分析:

《GenomeWide Analysis of Histone Modifications:H3K4me2, H3K4me3, H3K9ac, andH3K27ac inOryza sativa L. Japonica》文章中使用染色質免疫沉淀結合高通量測序(CHIP-seq)的方法研究了 H3K4me2、H3K4me3、H3K9ac 和 H3K27ac 這 4 個組蛋白修飾在水稻中全基因組分布。通過分析發表的 DNase-seq 數據,本研究探索了沿著水稻基因組的 DNase 超敏 (DH) 位點。組蛋白修飾主要出現在基因區,并圍繞著基因的轉錄起始位點(TSSs)富集。這項分析證明 4 種組蛋白修飾和 DNase 超敏位點都與活性轉錄相關。此外,4 種組蛋白修飾高度同時出現在轉錄區,推測其為一種用來為一種用來預測水稻基因注釋中缺失基因的可能特征。進一步研究驗證了該預測,確證了兩個預測的缺失基因的轉錄。與此同時,改研究還構建了一個序列模體分析的方法以鑒定 DH 位點和許多推斷的轉錄因子結合位點。

 


武漢愛基百客生物科技有限公司(愛基百客)作為國內提供 ChIP-seq 技術服務的翹楚,ChIP-seq 服務涉及物種 50+,組織類型 25+,組蛋白修飾的 ChIP-seq 服務更是與國內眾多課題組都有著長期合作。除此之外,轉錄因子等蛋白質與 DNA 互作服務,愛基百客都有著豐富的經驗。武漢愛基百客作為一家專業提供表觀遺傳學技術服務的生物公司,希望在表觀遺傳學領域為各位老師科研雪中送炭錦上添花。

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