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在人類的消化系統中，生存著一個由細菌構成的龐大生態系統，叫做腸道菌群或者腸道菌叢。zui 近的研究表明，這些微生物可以通過操縱大腦，讓宿主吃下不健康的食物，甚至讓宿主感覺緊張和消沉。這些都是細菌的生存環境優化策略的一部分。腸道微生物群可以通過迷走神經影響其宿主的進食模式。迷走神經是一條從腦延伸到腸道的神經， 微生物能夠修改迷走神經中的神經信號，改變味覺接收器，產生毒素以及釋放化學獎勵，并通過上述行為達到操控行為和情緒的目的。 
除了與迷走神經密不可分，腸道還連接著內分泌系統和免疫系統，這意味著這些微生物群還能夠影響這些系統，但是研究者尚未搞清楚具體的方式。 
微生物群與人體的細胞數量比是10比1（研究是1.3：1，盡管它們的細胞要遠比人類的?。?。細菌能讓它們的宿主渴望富含糖和脂肪的不健康食品，因此被認為是造成肥胖的因素之一。研究人員還發現我們的腸道菌群與腫瘤的生長有關，可能是一些胃癌以及其他類型癌癥的肇因。