液相色譜的保護柱，顧名思義是用來過濾樣品和流動相中的雜質，保護色譜柱，延長色譜柱的使用壽命的
安裝位置通常在進樣器之后，色譜柱前端。
保護柱再選擇時分兩種：
一種是獨立式卡套保護柱。卡套內放有柱芯，柱芯內含有填料，柱芯可以更換，而柱芯是根據色譜柱的類型來選擇的。
另一種是一體化卡套保護柱。這是一種特殊的色譜分析柱構造，色譜柱前端是一體化的，可以直接打開保護柱卡套。這種保護柱帶來的死體積較小，但是分析柱選擇時成本較普通分析柱更高。
值得注意的地方，保護柱的柱芯除了需要根據色譜柱的類型進行選擇，在第一次使用時是沒有方向的，但除此使用后就有了方向，不能再調換方向使用。
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