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1.取濾膜（直徑50mm）N張，浸泡在純化水里約5分鐘
2.用鑷子取出濾膜，平貼在不銹鋼網片上，將不銹鋼網片放入不銹鋼底
座里，放入墊片和O型圈，將螺蓋和杯體蓋緊組裝成一套完整的全封閉過濾培養器。
3.滅菌，用牛皮紙將組裝好的培養器包好，放入高壓濕熱滅菌鍋里進行滅菌（按照2005年中國藥典）的規定進行滅菌。
4.取滅菌好的培養器至微生物限度檢定室，進行集菌過濾。
5.打開配置好的固體培養基，將集菌好的濾膜平貼在培養基上（濾膜上不可以有氣泡產生）。
6.按照中國藥典的規定進行培養。
注意：
1.液層高度的控制方法：取下濾器頂部膠帽，向濾器內泵入沖洗液，沖洗液至適宜高度時，套上膠帽
2.沖洗時，若出現濾膜上無液層覆蓋現象，說明濾器內氣壓過高，取下膠帽放氣，然后套上。
3.應保持雙芯針頭空氣過濾器內濾膜的干燥，可確保氣流暢通。
4.根據樣品性狀，控制集菌儀適宜轉速，以進液管不出現氣泡為宜。若進液管出現氣泡，降低轉速即可避免，否則應檢查針頭是否被堵塞。
5.為便于操作，推薦選用帶膠塞的500ml玻璃瓶作稀釋容器