半乳糖氧化酶/Galactose oxidase

1. DNA帶模糊

1) DNA降解:避免核酸酶污染;

2) 電泳緩沖液陳舊:電泳緩沖液多次使用后,離子強度降低,pH值上升,緩沖能力減弱,從而影響電泳效果。建議經常更換電泳緩沖液;

3) 所用電泳條件不合適:電泳時電壓不應超過20V/cm,溫度<30℃;巨大DNA鏈電泳,溫度應<15℃;核查所用電泳緩沖液是否有足夠的緩沖能力;

4) DNA上樣量過多:減少凝膠中DNA上樣量;

5) DNA樣含鹽過高:電泳前通過乙醇沉淀去除過多的鹽;

6) 半乳糖氧化酶/Galactose oxidase有蛋白污染:電泳前酚抽提去除蛋白;

7) DNA變性:電泳前勿加熱,用20mM NaCl緩沖液稀釋DNA。

2. 不規則DNA帶遷移

1) 對于λ/Hind III片段cos位點復性電泳前于65℃加熱DNA 5分鐘,然后在冰上冷卻5分鐘;

2) 電泳條件不合適:電泳電壓不超過20V/cm;溫度<30℃;經常更換電泳緩沖液;

3) DNA變性:以20 mM NaCl Buffer稀釋DNA,電泳前勿加熱。

3. 帶弱或無DNA帶

1) DNA的上樣量不夠:半乳糖氧化酶增加DNA的上樣量;聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂糖電泳靈敏度稍高,上樣量可適當降低;

2) DNA降解:避免DNA的核酸酶污染;

3) DNA走出凝膠:縮短電泳時間,;

4) 對于EB染色的DNA,所用光源不合適:應用短波長(254nm)的紫外光源。

4. DNA帶缺失

1) 小DNA帶走出凝膠:縮短電泳時間,;

2) 分子大小相近的DNA帶不易分辨:增加電泳時間,核準正確的凝膠濃度;

3) DNA 變性:電泳前請勿高溫加熱DNA鏈,以20 mMNaCl Buffer稀釋DNA;

4) DNA鏈巨大,常規凝膠電泳不合適:在脈沖凝膠電泳上分析。

5. DNA電泳的Marker怎么是扭曲的?

1)半乳糖氧化酶(Galactose Oxidase)配制膠時的緩沖液需要和電泳緩沖液不是同時配制的。*是同時配制.電泳時緩沖液高過液面1-2mm即可。

2)電泳時電壓過高,可以在電泳前15分鐘用較低電壓(3V/cm),等條帶出孔后比較整齊了,再調高電壓。

3)上樣時盡量慢慢加樣,等樣品自然沉降后再加電壓。