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北京百泰派克生物科技有限公司
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從富集到鑒定:糖蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜方法全解讀
  • 從富集到鑒定:糖蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜方法全解讀
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更新時間:2025-07-23 21:56:06

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從富集到鑒定:糖dànbáizhì組學(xué)質(zhì)譜方法全解讀檢測技術(shù)服務(wù): 糖基化是zuì廣泛存在的dànbáizhì翻譯后修飾之一,在細胞識別、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫調(diào)節(jié)等多種生命過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。研究糖dànbáizhì組不僅有助于深入理解生物系統(tǒng)的精細調(diào)控機制,還在疾病機制解析和生物標志物發(fā)現(xiàn)中展現(xiàn)出巨大潛力。質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為糖蛋白的高通量鑒定和jīngquè定量提供了核心支撐。本文將全面梳理糖dànbá

從富集到鑒定:糖蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜方法全解讀檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

糖基化是zuì廣泛存在的dànbáizhì翻譯后修飾之一,在細胞識別、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫調(diào)節(jié)等多種生命過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。研究糖dànbáizhì組不僅有助于深入理解生物系統(tǒng)的精細調(diào)控機制,還在疾病機制解析和生物標志物發(fā)現(xiàn)中展現(xiàn)出巨大潛力。質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為糖蛋白的高通量鑒定和jīngquè定量提供了核心支撐。本文將全面梳理糖dànbáizhì組學(xué)研究中從樣本處理、糖肽富集、質(zhì)譜檢測到數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵環(huán)節(jié),幫助科研人員系統(tǒng)掌握該領(lǐng)域的實驗與分析策略。


一、糖dànbáizhì組學(xué)研究的核心挑戰(zhàn)

糖基化修飾具有高度的位點選擇性和糖鏈結(jié)構(gòu)多樣性,使得糖蛋白的系統(tǒng)性分析遠比總dànbáizhì組更具復(fù)雜性。研究人員需面對以下關(guān)鍵難點:


  • 糖蛋白在整體dànbáizhì組中豐度較低,信號易被掩蓋

  • 糖鏈結(jié)構(gòu)異質(zhì)性強,增加了質(zhì)譜解析難度

  • 糖肽碎裂模式復(fù)雜,常規(guī)算法難以準確注釋


解決這些問題,需要在樣本制備、富集策略和質(zhì)譜方法上進行高度優(yōu)化,并輔以專門的數(shù)據(jù)處理流程。


二、樣本預(yù)處理與糖肽富集策略

在糖dànbáizhì組學(xué)分析中,糖肽的有效富集是確保下游質(zhì)譜靈敏度和特異性的前提。

1、HILIC親水作用色譜

基于糖鏈較強的親水性,HILIC色譜可高效區(qū)分糖肽與非糖肽組分,適用于大規(guī)模篩查糖蛋白修飾位點,具有良好的重現(xiàn)性和通量。


2、凝集素親和捕獲

使用多種凝集素針對特定糖結(jié)構(gòu)進行識別與富集,能在一定程度上提高對不同糖型蛋白的覆蓋,但需結(jié)合目標研究設(shè)計凝集素組合,避免偏向性。


3、氧化-肟化富集法

通過氧化糖鏈中的順式二醇基團生成醛基,并與肟基或水解肼進行選擇性化學(xué)結(jié)合,捕獲糖肽,適合結(jié)構(gòu)研究和O-糖肽富集。


※ 各類富集策略應(yīng)根據(jù)樣本特性與研究目標靈活組合,以實現(xiàn)更全面的糖蛋白覆蓋。


三、酶切與糖鏈處理策略

在蛋白酶切階段,常用yídànbáiméi或Gluc-C酶生成適合質(zhì)譜分析的肽段。針對N-糖蛋白分析,酶切后可選擇進行PNGase F處理,去除糖鏈并在N位天冬酰胺上形成+1 Da的質(zhì)量位移,有助于定位糖基化位點。若研究關(guān)注糖鏈結(jié)構(gòu),則應(yīng)保留糖鏈信息,通過優(yōu)化碎裂模式獲取糖鏈與肽段的組合信息。


四、質(zhì)譜平臺與碎裂模式優(yōu)化

高分辨質(zhì)譜平臺結(jié)合多種碎裂方式已成為糖dànbáizhì組研究的標準配置。三種常見碎裂模式各有優(yōu)勢:

1、HCD(高能碰撞裂解)

適于產(chǎn)生典型糖鏈氧離子(如HexNAc+、Hex+),有助于識別糖型和結(jié)構(gòu)特征,適合定量研究。


2、ETD(電子轉(zhuǎn)移裂解)

在保留糖鏈完整性的同時裂解肽段骨架,適合定位糖基化位點,尤其在保留修飾信息方面優(yōu)勢顯著。


3、EThcD(聯(lián)合裂解)

結(jié)合HCD與ETD信號,可在一次掃描中同時獲得糖鏈與肽段信息,提升糖肽鑒定的深度與準確性。


※ 碎裂模式的選擇需結(jié)合實驗?zāi)康暮蛢x器配置進行調(diào)整,尤其在大規(guī)模分析或高通量篩查中尤為關(guān)鍵。


五、數(shù)據(jù)處理與糖肽結(jié)構(gòu)解析

糖dànbáizhì組數(shù)據(jù)的分析是當前技術(shù)發(fā)展的重點之一。標準流程包括:


  • 原始譜圖質(zhì)量控制與峰提取

  • 與數(shù)據(jù)庫匹配獲取糖肽候選序列

  • 基于碎片離子與糖鏈特征進行打分篩選

  • 確認糖基化位點與糖鏈結(jié)構(gòu)


*的搜索引擎已逐步支持異構(gòu)糖鏈識別、多糖型匹配以及定量分析,提升結(jié)果的可解釋性與重現(xiàn)性。同時,人工驗證與交叉比對仍在某些關(guān)鍵研究中bùkěhuòquē,特別是在新型糖鏈結(jié)構(gòu)或未知修飾位點的研究中。


六、糖dànbáizhì組定量策略

定量分析是理解糖蛋白功能變化的關(guān)鍵。常見定量方法包括:


  • TMT/iTRAQ多肽標記:可實現(xiàn)多樣本并行定量,適合差異表達篩查

  • Label-free定量:不依賴標簽,靈活性高,適合復(fù)雜樣本組分析

  • 糖鏈特異性標記策略:結(jié)合化學(xué)標記提高特定糖肽的定量靈敏度


高質(zhì)量定量結(jié)果需結(jié)合生物信息學(xué)方法進行統(tǒng)計與通路富集分析,識別關(guān)鍵調(diào)控節(jié)點。


糖dànbáizhì組學(xué)正推動我們對細胞調(diào)控機制的深入理解,其在疾病診斷、靶點發(fā)現(xiàn)及生物藥開發(fā)中的應(yīng)用潛力不斷擴展。基于質(zhì)譜的研究平臺正在不斷演進,推動糖基化研究向更高分辨率和更廣覆蓋度發(fā)展。針對糖dànbáizhì組學(xué)的復(fù)雜需求,百泰派克生物科技提供覆蓋全流程的一體化服務(wù)方案。我們將持續(xù)優(yōu)化富集、檢測與解析流程,為科研人員提供可信賴、高效能的糖dànbáizhì組學(xué)整體解決方案。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準確。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)*,*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

從富集到鑒定:糖蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜方法全解讀




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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