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什么是DIA與SWATH？一文了解數(shù)據(jù)非依賴采集技術(shù)檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

質(zhì)譜技術(shù)是現(xiàn)代dànbáizhì組學(xué)研究的核心工具，而采集策略的不同，決定了實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的覆蓋率、重復(fù)性和定量精度。近年來，數(shù)據(jù)非依賴采集技術(shù)（Data-Independent Acquisition, DIA）迅速崛起，并逐漸成為取代數(shù)據(jù)依賴采集（Data-Dependent Acquisition, DDA）的主流趨勢。在DIA技術(shù)體系中，zuì具代表性的實(shí)現(xiàn)方式便是SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Spectra）。本文將帶你系統(tǒng)了解DIA與SWATH的原理、區(qū)別、優(yōu)勢及其在科研和臨床研究中的典型應(yīng)用。

一、什么是DIA？

DIA（Data-Independent Acquisition）是一類質(zhì)譜采集策略，其核心特點(diǎn)是不依賴母離子強(qiáng)度實(shí)時(shí)選擇碎裂目標(biāo)，而是系統(tǒng)性地對(duì)全部m/z范圍進(jìn)行分段采集。相比DDA策略中只碎裂zuì強(qiáng)信號(hào)的前若干個(gè)母離子（TopN），DIA更接近于一種“全量掃描"模式，能同時(shí)獲取更全面、重復(fù)性更強(qiáng)的MS/MS數(shù)據(jù)。

? DIA的優(yōu)勢在于：

• 無偏采集，覆蓋更全：不漏掉低豐度蛋白；

• 采集邏輯固定，重復(fù)性強(qiáng)：適合大規(guī)模樣本分析；

• 全譜保存，可反復(fù)挖掘：數(shù)據(jù)生命周期更長。

二、什么是SWATH？

SWATH-MS是DIA技術(shù)中zuì早被標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)現(xiàn)和商業(yè)推廣的版本。它的設(shè)計(jì)理念是：將質(zhì)譜的掃描范圍（如400–1200 m/z）劃分為多個(gè)等寬或變寬的窗口（例如25 Da），并對(duì)每個(gè)窗口中的所有母離子進(jìn)行同步碎裂，然后記錄所有碎片離子信息。

? SWATH的dútè優(yōu)勢包括：

• 采集窗口連續(xù)覆蓋，無盲區(qū)；

• 平臺(tái)成熟，算法完善（如OpenSWATH、PeakView、Spectronaut）；

• 適用于血漿、腫瘤等高復(fù)雜樣本類型；

• 已被廣泛用于臨床轉(zhuǎn)化研究和多中心大隊(duì)列研究。

三、DIA與SWATH的關(guān)系與區(qū)別

四、DIA/SWATH的技術(shù)優(yōu)勢

1、全譜采集，不遺漏任何信號(hào)

無論是DIA的library-free方案，還是SWATH的窗口分段采集，均實(shí)現(xiàn)了對(duì)所有母離子的全面覆蓋，顯著提升低豐度蛋白的檢測能力。

2、高重復(fù)性，適合大規(guī)模研究

預(yù)設(shè)掃描策略避免了DDA隨機(jī)采集帶來的數(shù)據(jù)波動(dòng)，確保跨樣本、跨批次的數(shù)據(jù)一致性，尤其適合多中心、長期隊(duì)列研究。

3、可重復(fù)挖掘，數(shù)據(jù)價(jià)值zuì大化

由于碎片數(shù)據(jù)已被全量記錄，DIA/SWATH采集的數(shù)據(jù)可支持后期重新分析，不必重復(fù)上機(jī)，大幅提升數(shù)據(jù)利用率和研究效率。

五、典型應(yīng)用場景

1、腫瘤蛋白組學(xué)

SWATH技術(shù)在腫瘤組織樣本中表現(xiàn)出優(yōu)異的定量穩(wěn)定性與組間可比性，助力發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證腫瘤生物標(biāo)志物。

2、藥物作用機(jī)制研究

DIA全譜掃描能力可系統(tǒng)捕捉蛋白表達(dá)變化，幫助還原藥物干預(yù)下的信號(hào)通路動(dòng)態(tài)，為新藥研發(fā)提供強(qiáng)有力支持。

3、臨床復(fù)雜樣本高通量分析

如血漿、腦脊液等樣本背景復(fù)雜，SWATH平臺(tái)的數(shù)據(jù)一致性和抗干擾能力顯著優(yōu)于DDA，適合構(gòu)建高可靠性臨床蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)庫。

4、多中心大隊(duì)列研究

SWATH-MS因其采集方式固定，特別適合在不同儀器和不同批次之間進(jìn)行數(shù)據(jù)對(duì)齊與對(duì)比，已廣泛用于大型多機(jī)構(gòu)合作項(xiàng)目。

DIA技術(shù)正推動(dòng)dànbáizhì組學(xué)進(jìn)入一個(gè)“全面、高通量、可重復(fù)"的新時(shí)代。而SWATH作為其zuì成熟的實(shí)現(xiàn)路徑，為科研人員提供了穩(wěn)定、可靠、低門檻的進(jìn)入方式。百泰派克生物科技融合優(yōu)良質(zhì)譜平臺(tái)與多維算法，提供高質(zhì)量的SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)。無論您是初涉DIA的新用戶，還是尋求更高數(shù)據(jù)質(zhì)量的研究團(tuán)隊(duì)，百泰派克生物科技都將是您可信賴的合作伙伴。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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