真空平行濃縮儀適合于較為敏感的生物樣本，比如蛋白質以及氨基酸等等，更為重要的還在于，在獲得樣品的同時，也不會產生任何交叉性的污染以及存在樣品變性的可能性，或者是存在活性降低以及氧化的可能具備良好的穩定性。相對于其他濃縮方法，真空平行濃縮儀的優點是樣品的回收率較高，對環境的危害比較小，并且一般的真空離心濃縮儀操作較為簡單，無需復雜的實驗設計等。
1.開機后先檢查儀器使用情況，如有儀器損壞，則立即暫停實驗并通知儀器管理人員。
2.上樣:將樣品管平衡放在轉子上，一定要確保良好的對稱性。
3.設置加熱溫度:根據溶劑的性質，在不破壞樣本的前提下盡可能提高運行溫度，可以加快蒸發過程。
4.設置時間:先設置加熱時間，再設置運行時間，為防止一些熱敏感。樣品在溶劑蒸發完后受到過量的熱量，加熱器一般設置為先于離心濃縮儀關機前關閉，關好蓋子，按“RUN”鍵開始運行,待轉子達到操作溫度時，真空閥會關閉，真空泵運行，若此時真空泵未運行，請聯系相關負責人。
5.運行時間結束后，有一聲音提示，這時表示離心濃縮過程結束，取出樣品檢查。樣品濃縮情況，若為達到濃縮要求可以再次設定加熱和運行時間，再運行一次;
6.儀器使用結束后，關閉電源開關，并填寫儀器使用記錄。
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