固相萃取儀將固相萃取的各個步驟有效的集成于一個平臺，可實現整個固相萃取過程(活化、上樣、淋洗、干燥、洗脫)的全自動操作，大大提高了樣品前處理的效率，將分析工作者從繁瑣的前處理工作中解脫出來，使樣品前處理更快捷、高效。
固相萃取儀實驗過程中遇到的問題及解決方法：
1、篩板堵塞
常見的固相萃取柱通常由柱管、篩板和填料3部分組成，其中篩板是一種具有多孔結構的材料，起到固定填料和過濾溶液的作用。
當上樣液中含有較多顆粒雜質時，這些顆粒雜質會在篩板上不斷聚集，在篩板上端形成一層顆粒層，隨著壓力的增加以及時間的延長，顆粒層會越來越嚴實，最終導致篩板堵死，溶液無法通過固相萃取柱。
遇到這種情況，可以在上樣前先高速離心或者過濾，然后取上清液或者濾液過固相萃取柱，減少顆粒雜質的影響。
2、流速緩慢
固相萃取過程中流速不能太快，流速太快不利于目標化合物在填料上的保留以及溶劑與目標化合物或者填料的相互作用，從而影響保留或者洗脫過程。當然流速也不能太慢，否則會大大延長前處理的時間。
原因：
2.1樣品粘度高，例如食品中遇到濃縮汁、糖果時，需要對樣品充分稀釋，降低上樣液的濃度；
2.2填料較多或者太緊密，此時需要增強負壓或者減少填料的使用量；
2.3溶劑極性不匹配，例如SN/T1924-2011中淋洗固相萃取柱時，先用水、甲醇，接著用正己烷淋洗，正己烷與前兩者的極性不同，從而導致流速很慢，遇到這種情況，可以增加負壓或者選用合適的溶劑進行過渡。
3、凈化效果不理想
通常固相萃取柱有兩種凈化模式，一種是采用保留目標化合物的模式，另一種是采用保留雜質的模式，不管采用哪種模式都需要選擇合適的填料，使得目標化合物或者雜質能吸附在填料中，同時不需要保留的組分盡可能多的隨著溶劑一同流出固相萃取柱。
在保留化合物模式下凈化樣品時，通常會經歷上樣、淋洗和洗脫三個步驟。淋洗和洗脫溶劑選擇的不合適也會使得凈化效果不理想。
4、重現性差
固相萃取中重現性差通常與產品質量、流速以及操作有關。固相萃取柱中填料的質量、均勻性和松緊度都可能影響到方法的重現性，因此選擇質量可靠的廠家很重要，遇到重現性差的實驗，可以選擇用標準溶液考察一下固相萃取柱的重現性。
固相萃取過程中流速的快慢也是影響重現性的重要因素之一，上樣、淋洗、洗脫過程中適當降低流速，通常而言，流速低于5mL/min時結果較為穩定，有些實驗可能需要更慢的流速。當然，操作者水平的高低也會影響到結果的重現性。
5、回收率不理想
在實驗中，操作者關注較多的可能也是關于加標回收率的問題，固相萃取柱質量的優劣、固相萃取方法是否合適、操作者操作技能的高低都可以通過加標回收實驗進行驗證。原則上加標回收率應在80%~120%之間，當然對于多組分目標物同時檢測時，這一指標可適當放寬。
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