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Label free實驗
Label free: 非標定量蛋白質組學技術;
比如你有10個組織樣品,分別提取蛋白質并酶解成肽段。然后每一個肽段樣品進行LC-MS分析,這樣就得到10個MS數據;
對于1條肽段,其在10個樣品中的豐度(量)與其在MS1中的峰面積或信號強度成正比;
理論上,對于10個樣品中的同一條肽段,其在LC上的保留時間(retention time, RT)是一致的,因此,可以通過對比MS圖譜,實現對蛋白質在不同樣本中的相對表達水平的定量分析。
Label free實驗技術特色:
1、與SILAC, iTRAQ/TMT技術相比,樣品無需標記,能終程度地保留樣品的“真實性”;
2、樣品處理步驟簡單,蛋白質只需酶解即可進行LC-MS分析;
3、能很大程度的節省樣本制備費用。
Label free分析軟件
Maxquant,Progenesis 等。
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