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兒童感染肺炎衣原體的幾率較低，到中年時感染率急劇增高，到老年時持續增(>50%)。樣本采集的困難性和被感染部位的不易接近性嚴重影響直接檢測方法的有效性。因此，在直接檢測方法不是很有效的情況下，血清學檢測作為遠端和慢性衣原體感染鑒定的非入侵性工具，常規應用于臨床。此外，特定的抗體類型的出現也能指示出疾病的狀態。
早期衣原體感染的特征是在2-4周內出現IgM抗體，隨后6-8周內才有IgA和IgG反應。在急性感染肺炎衣原體后，IgM抗體在2-6個月內會消失而IgG抗體滴度會慢慢減少，而IgA抗體趨向于迅速消失。當懷疑衣原體初步感染時，IgM的檢測有高度的診斷意義。然而，重復和慢性感染時IgM水平是比較低的，因此如果沒有檢測到IgM并不排除正在感染的可能性。對于重復感染，IgG和IgA水平升高較快，通常在1至2周內。
肺炎衣原體試劑盒可通過檢測IgM抗體來早期診斷肺炎衣原體現癥感染。僅用于體外診斷。肺炎衣原體(TWAR)是一種新出現的有傳染性的因子，可引起一系列臨床表現，包括上呼吸道和下呼吸道感染。衣原體肺炎感染一般是溫和的、無癥狀的，然而，肺炎衣原體感染可能會引起一些嚴重的疾病如：咽炎、竇炎,急性支氣管炎和社區獲得性肺炎。如果未檢測出和未進行治療，此感染可能會導致長期持久的疾病。的數據顯示了肺炎衣原體感染和慢性疾病的關聯。
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