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操作使用生化培養箱時不宜在高電壓、大電流、強磁場等反常環境下使用生化培養箱，以免干擾損壞及發生危險，清潔生化培養箱的時候，用浸泡酒精的紗布擦拭箱體內壁進行滅菌消毒，然后用干紗布將酒精擦除干凈，長期不使用該設備，請拔掉電源，同時做好每次使用儀器的操作，故障記錄，有問題及時維修。
具體要注意的幾點如下：
開啟生化培養箱前應全面熟悉和了解各組成配套儀器、儀表的說明書、掌握正確的使用方法；盡可能地安裝于空氣清靜，溫度變化較小的地方，具使用三腳插頭，插座應妥善接地；嚴禁含有易揮發性化學溶劑，爆炸性氣體和可燃性氣體置于箱內;培養箱附近不可使用可燃性噴霧劑，以免電火花引燃；培養結束后，把電源開關撥至“0”處，如不馬上取出物品，請不要打開箱門；為保證冷凝器有效地散熱，冷凝器與墻壁之間距離應大于100mm。箱體側面應有50mm間隙，箱體頂部至少應有300mm空間；生化培養箱箱內外應每日保持清潔，每次使用完畢應當進行清潔。長期不用應蓋好塑料防塵罩，放在干燥，室內箱壁內膽和設備表面要經常檫拭，以保持清潔，增加玻璃的透明度。請勿用酸、堿或其它腐蝕性溶液來檫拭外表面。
生化培養箱停止使用，關閉總電源鍵，及設備后部的電源開關，同時，工作時，應避免頻繁開門，以保持溫度穩定，同時防止灰塵污物進入。
設備長期不用，應拔掉電源線以防止設備損傷人。并應定期(一般一季度)按使用條件運行2-3天，以驅除電器部分的潮氣，避免損壞有關器件 。
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