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生物反應器是目前比較新的一類反應器，它其體積從10ml到2m3不等，可用于疫苗生產、蛋白重組、篩選試驗等多個領域。它的核心組成部分是帶有預先滅菌功能的培養容器，其制作材料非常特殊，只能進行單次使用，不可以重復利用，故此稱之為生物反應器。不同類型的培養在材料的選取、結構設計、功率輸入等方面均有所差別。
它的基本類型：
1、微生物反應器：
微生物反應器是生產中最基本也是最主要的設備，其作用就是按照發酵過程的工藝要求，保證和控制各種生化反應條件，如溫度、壓力、供氧量、密封防漏防止染菌等，促進微生物的新陳代謝，使之能在低消耗下獲得較高的產量。
厭氧生物反應器：其反應器不需供氧，設備結構一般較為簡單。應用于乙醇、啤酒、丙酮、丁醇的生產；
好氧生物反應器：生產過程中需不斷通人無菌空氣，因而其設備的結構比厭氧生物反應器復雜。
2、酶反應器：
酶反應器是根據酶的催化特性而設計的反應設備。其設計的目標就是生產效率高、成本低、耗能少、污染少，以獲得較好的經濟效益和社會效益。酶反應器的種類有常用于飲料和食品加工工業的攪拌罐型反應器，使用Z廣泛的固定化酶反應器的固定床型反應器，適合于生化反應的膜式反應器等。每種類型的反應器各有優缺點，應根據不同需要進行選擇。
3、動植物細胞反應器：
動植物生物反應器產生于19世紀80年代，此中生物反應器的主體是動植物細胞，主要是按照動植物細胞的生長要求，控制各種生化條件，促進動植物細胞的新陳代謝，以獲得人們所需要的代謝產物。由于動物細胞培養的難度，目前所用的Z理想的動植物細胞反應器是哺乳動物的乳腺，由此可以生產抗體、基因重組蛋白質藥物、病毒疫苗等生物技術產品，有非常好的前景。
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