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生物毒性是評價水質毒性的另一個重要的方面，日常生活中接觸到的化學品多達4-8萬種，單純用化學監測技術手段進行水質檢測并不能保證安全。基于生物毒性研究的綜合毒性檢測方法成為最佳的選擇，這種方法將水體對活體生物，例如發光菌、藻類、大型蛋和魚類的直接作用量化并形成檢測方法。
水質毒性分析儀特別適合于飲用水及土壤毒性監測和對對突發的水體污染事件的快速檢測。也可用于監測管網里檢測受污染土壤、河流和沿海帶底泥的急性毒性。除此之外，還適用于：
檢測危險物質變化、污水處理廠進水和出水的相對毒性等等。
檢測純化合物(有機分子、無機金屬離子)的急性毒性。
檢測受污染水體(工業排放污水、礦山采礦和冶煉廢水、河水等水系)的急性毒性。
檢測研究有毒元素以及化合物相互之間的相互作用-協同或拮抗效應。
英國現代水務/ModernWater Microtox FX 水質毒性分析儀是一款簡單快捷且靈敏度較高的便攜式水質檢測儀，專門為篩查急性毒性及三磷酸腺苷(ATP)而設計。Microtox FX 便攜式急性毒性分析儀使用生物熒光技術，對飲用水污染及化學品進入水體等造成的緊急事件進行快速毒性檢測。Microtox FX是使用 Microtox技術進行毒性測定的便攜儀器。
這款儀器應用了公司的Microtox分析技術，對超過2,700種復雜化合物敏感，且對飲用水中微生物的檢出限低至100cfu/ml。Microtox技術已在超過700篇經同行評議的文獻中被引用，該技術因其可靠性和易用性已被各國監管部門列為水質急性毒性分析的標準方法。
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