裂解與保護成分:除異硫氰酸胍外,部分總 RNA 提取試劑還包含 β - 巰基乙醇,其作為強還原劑,能進一步破壞 RNase 中的二硫鍵,協同增強對 RNase 的抑制效果,確保 RNA 在提取過程中不被降解 。此外,試劑中的緩沖體系(如 Tris - HCl)維持提取過程中的 pH 穩定,通常將 pH 控制在酸性范圍(約 pH 4.5 - 5.5),此環境下 DNA 更易分配至有機相,有助于 RNA 與 DNA 的有效分離。
純化輔助成分:異丙醇常用于沉淀水相中的 RNA。在加入異丙醇后,RNA 分子因溶解度降低而析出,通過離心可形成 RNA 沉淀,便于后續收集 。75% 乙醇則用于洗滌 RNA 沉淀,去除殘留的鹽離子和有機試劑,減少雜質對 RNA 質量的影響,獲得純度較高的總 RNA。
動物組織樣本:取適量新鮮或液氮凍存的動物組織(如 50 - 100 mg),置于預冷的研缽中,加入液氮迅速研磨成粉末狀。將研磨后的組織粉末轉移至含有適量總 RNA 提取試劑的離心管中,劇烈振蕩 15 - 30 秒,使組織與試劑充分混合,室溫靜置 5 分鐘,確保細胞充分裂解 。加入氯仿后,振蕩混勻,室溫離心(12000 rpm,15 分鐘),此時溶液分為三層,RNA 位于上層水相。小心吸取水相至新的離心管,加入異丙醇沉淀 RNA,再次離心收集 RNA 沉淀,用 75% 乙醇洗滌后晾干,最后用適量 RNase - free 水溶解 RNA。
植物組織樣本:由于植物細胞具有細胞壁,可先將植物組織(如葉片、幼芽)在液氮中研磨成細粉,后續操作與動物組織類似 。但部分植物組織富含多糖、多酚等次生代謝物,可能干擾 RNA 提取。可在提取過程中加入 PVP(聚乙烯吡咯烷酮)等吸附劑,或通過高鹽低 pH 值緩沖液洗滌等方法去除雜質,提高 RNA 純度。
細胞樣本:對于貼壁細胞,吸去培養基后,直接在培養板中加入適量總 RNA 提取試劑,用槍頭反復吹打使細胞裂解,將裂解液轉移至離心管;懸浮細胞則先離心收集細胞,再加入試劑裂解 。后續步驟與組織樣本提取相同,通過氯仿抽提、異丙醇沉淀和乙醇洗滌獲得 RNA 樣本。
試劑儲存與使用規范:嚴格按照產品說明書儲存總 RNA 提取試劑,避免高溫、光照和反復凍融,防止試劑成分失效 。使用前將試劑平衡至室溫,操作過程中佩戴手套、口罩,使用 RNase - free 的耗材,避免外源 RNase 污染樣本,影響 RNA 質量 。
樣本處理細節:確保樣本新鮮,避免長時間放置導致 RNA 降解。對于凍存樣本,需在液氮或干冰條件下運輸和保存 。在研磨組織樣本時,要迅速充分,防止樣本融化;細胞裂解過程中,保證細胞裂解,可適當延長振蕩或吹打時間 。
優化實驗條件:不同生物樣本的成分和結構存在差異,可通過預實驗優化試劑用量、裂解時間、離心條件等參數 。對于 RNA 含量較低或雜質較多的樣本,可增加樣本起始量或采用多次洗滌、純化步驟,提高 RNA 提取質量。
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