單細胞及微量樣本的DNA甲基化組學研究很大程度上受制于建庫測序技術。傳統的文庫構建方法或類似于基因組DNA的單細胞擴增技術很難應用到甲基化實驗過程中。易基因建立了基于線性擴增和單管建庫的技術，可充分降低文庫偏好性，準確的完成珍貴樣本的全基因組甲基化研究。

單細胞及微量珍貴樣本的甲基化研究主要應用于腫瘤發生機制，癌癥研究，胚胎植入前診斷，胚胎早期發育，生殖細胞重組，干細胞及細胞異質性等研究領域。應用的樣本包括單細胞、微量細胞等。

技術優勢：

?  超低起始量：僅需大于5ng的DNA或微量的細胞；

?  樣本種類繁多：細胞、FFPE、cfDNA；

?  單堿基分辨率：可精確分析每一個C堿基的甲基化狀態。

實驗策略：

分析內容：

注：個性化分析、多組學關聯分析請聯系對接銷售或技術支持

送樣要求：

經典案例

人類植入前胚胎發育的單細胞DNA甲基化組圖譜

Zhu, P., et al. (2018). "Single-cell DNA methylome sequencing of human preimplantation embryos." Nat Genet 50(1):

1、背景

在哺乳動物基因組上，胞嘧啶（主要是CpG二連體中的胞嘧啶）在DNA甲基化酶的催化下會發生甲基化。研究顯示，DNA甲基化對多個生物學過程都至關重要，如基因表達抑制、轉座子轉錄活性調節、X染色體的失活，以及基因組印記的維持等。此前研究顯示在著床前的早期胚胎發育

過程中只有大規模的DNA去甲基化。而此次研究數據顯示，精子和卵細胞結合受精之后，在人類早期胚胎大規模DNA去甲基化的同時，也在大量高度特異的DNA從頭加甲基化，這表明在人類早期胚胎DNA甲基化組重編程過程中，全局的DNA去甲基化‘凈結果’實際上是高度有序的大規模DNA去甲基化和局部DNA加甲基化兩種分子過程相互拮抗產生的動態平衡的結果。

2、方法

利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法，在單細胞分辨率對人類植入前胚胎發育過程進行了更加深入的分析。

3、結論

在這篇文章中，為了進一步在單細胞水平研究DNA甲基化重編程過程的動態特征，利用單細胞全基因組DNA甲基化組高通量測序技術，對人類植入前胚胎發育的各個關鍵階段進行了單細胞、單堿基分辨率的系統研究，主要發現有：（ 1）發現了人類植入前胚胎發育過程中存在大量特異性的DNA從頭加甲基。（2）發現從二細胞胚胎階段開始父母本基因組上的剩余甲基化水平發生逆轉，在同一個單細胞中母本基因組上的剩余甲基化水平顯著高于父本基因組上的剩余甲基化水平。（3）發現DNA甲基化在早期胚胎卵裂過程中的不對稱分配可以用來追溯同一個胚胎中每個細胞的遺傳譜系。

植入前胚胎不同發育階段DNA甲基化的動態變化

參考文獻：

①     DOI:10.1038/s41588-017-0007-6