哺乳動物中最主要的DNA修飾是5mC(5-甲基胞嘧啶),占人類DNA中總胞嘧啶的3%～6%。相反,5mC在原核生物中很少,而6mA(N6-甲基腺嘌呤,對應RNA上的修飾成為m6A,請注意區分)則是原核生物中代表性的DNA修飾,主要參與限制-修飾系統(restriction-modification),保護個體免受外來DNA的侵入,盡管哺乳動物中缺乏已知的限制-修飾系統,但近年來的研究在真核生物,甚至包括哺乳動物和植物基因組中鑒定到了6mA,并發現6mA在生長發育和疾病調控中具有重要作用。該技術利用DNA 6mA修飾特異的抗體對基因組上發生6mA修飾的區域進行富集,結合高通量測序,對基因組上的6mA修飾進行定位。

技術優勢：

?  檢測范圍廣：在全基因組范圍進行檢測。

?  針對性強：針對基因組上有6mA修飾的區域進行檢測,降低測序量,減少成本。

?  適用范圍廣：適用于大部分物種。

實驗策略：

基因組DNA→樣本檢測→打斷→接頭連接→抗體富集→PCR擴增→文庫質控→上機測序

分析內容：

注：個性化分析、多組學關聯分析請聯系對接銷售或技術支持

送樣要求：

經典案例

果蠅胚胎發育早期6mA圖譜的繪制及6mA結合蛋白的鑒定

6mA-DNA-binding factor Jumu controls maternalto-zygotic transition upstream of Zelda

1、背景

在胚胎發育早期，合子基因組如何精確地被母本因子激活，從而實現正常的胚胎發育，是一個長期存在的問題。

2、方法

利用6mA-seq技術繪制了果蠅胚胎發育早期的6mA圖譜，并通過6mA修飾區域的motif的分析，鑒定出胚胎發育早期關鍵的6mA結合蛋白。

3、結論

繪制了果蠅胚胎發育早期6mA圖譜；6mA結合蛋白Jumu可能通過調節Zelda的表達而在合子基因組激活過程中起到重要作用。

參考文獻：

①     DOI:10.1038/s41467-019-10202-3